Molekulare Mikrobiologie

MOLEKULARe MIKROBIOLOGIE

Sepsis und andere schwere Infektionen werden hauptsächlich durch Bakterien oder Pilze verursacht. Die frühzeitige Identifizierung des verursachenden Erregers ist entscheidend für eine wirksame und erfolgreiche Behandlung mit Antibiotika, Antimykotika, unterstützenden Medikamenten und für begleitende Therapien. Die molekularen Erregertests von Cube Dx unterstützen Mikrobiologen und Spezialisten für Infektionskrankheiten bei der frühzeitigen Erkennung von Sepsis verursachenden Erregern in Vollblut und anderen Probenmatrices. 

Besonders wichtig ist dies für Mikroorganismen die durch eine antimikrobielle Behandlung geschwächt wurden oder die in mikrobiologischen Nährmedien nur langsames Wachstum zeigen. Der molekulare Test von Cube Dx ist aufgrund seines breiten mikrobiellen Spektrums ideal dafür geeignet Erreger schwerer Infektionen wie einer Sepsis nachzuweisen.

87 Mikroorganismen / Resistenzgene - in 3 Stunden

SEPSISDIAGNOSE - OHNE KULTIVIERUNG / AUS BLUT

Cube Dx unterstützt die behandelnden Ärzte bei Verdacht auf eine Sepsis indem der Test einen sehr frühen Hinweis auf Sepsis verursachende Mikroorganismen direkt aus Vollblut liefert. Der Test verkürzt die Zeit bis zum Ergebnis auf nur 3 Stunden!

Unsere Multiplex-Technologie ermöglicht die gleichzeitige Identifizierung von 87 Targets (Mikroorganismen und Resistenzgene). 

Als Probe dient 0,5mL frisches EDTA-Blut. Zur Validierung eines negativen Ergebnisses kann optional eine interne Prozesskontrolle (IPC) in die Probe gegeben werden.

Während des GINA-Prozesses wird die Mehrzahl der menschlichen Zellen abgetrennt, bevor die DNA gereinigt wird. 

Die angereicherte mikrobielle DNA wird mit den PCR-Mastermixen amplifiziert: der Anwender wählt je nach klinischer Situation alle oder einzelne aus den zur Verfügung stehenden PCR-Mixen aus (pan-bakterielle, pan-fungale PCR und eine Multiplex-PCR auf verschiedene Resistenzgene).

Positive Proben werden in die hybcell-Kartuschen überführt und die Mikroorganismen und Resistenzgene durch das compact sequencing identifiziert. Die Ergebnisse werden automatisch in einem kompakten Bericht zusammengefasst.    

31 Mikroorganismen - in 2 Stunden

DIAGNOSE EINER LUNGENENTZÜNDUNG - OHNE EXTRAKTION / AUS BAL

Mit den hochempfindlichen PCR-Mastermixen von Cube Dx kann BAL direkt getestet werden - ohne dass eine DNA-Extraktion erforderlich ist. Ein einfacher Modulationspuffer - LINA - wird zur Modulation und Homogenisierung der BAL-Probe verwendet. Durch die Verwendung des extraktionsfreien Protokolls verkürzt sich die Zeit bis zum Ergebnis auf nur 2 Stunden.

Der LINA-Modulationspuffer wird für Proben mit einer relativ hohen Konzentration von Erregern, z. B. BAL, verwendet. Nur wenige µl BAL werden in das gebrauchsfertige LINA-Reaktionsgefäß gegeben und die Lösung kurz gemischt. Die Mischung wird anschließende direkt für die PCR verwendet. Dabei werden die gleichen Produkte (PCR und hybcell) wie für die Testung der Sepsiserreger verwendet. Eine Softwareoption beschränkt die Ausgabe auf das CE-IVD-zertifizierte Panel für Pneumonie.

Der LINA-Transfer- und Modulationspuffer verkürzt die Zeit für die molekulare Identifizierung auf 2 Stunden, weil der DNA-Extraktionsprozess entfällt.         

100 Mikroorganismen / Resistenzgene - in 2 Stunden

MIKROBIELLE IDENTIFIZIERUNG - DIREKT AUS POSITIVER BLUTKULTUR

Cube Dx bietet eine schnelle DNA-basierte Identifizierung von Mikroorganismen die in Blutkulturen gewachsen sind. Es ist keine weitere Reinkultur erforderlich und selbst langsam wachsende Mikroorganismen können parallel zum dominierenden Erreger identifiziert werden. Der Test kann beispielsweise als Backup-System zu einer MALDI-TOF basierten Identifizierung etabliert und verwendet werden. 

Der LINA-Puffer bietet einen einfachen, schnellen und effizienten Weg zur Identifizierung krankheitsverursachender Erreger mit nur 1 Minute Zeit für die Handhabung. Wenige µl einer positiven Blutkultur können direkt in den LINA-Puffer gegeben werden ohne dass eine Reinkultur erforderlich ist. Das Gemisch wird in die PCR überführt und die Identifizierung erfolgt mit der hybcell - das Ergebnis wird in 2 Stunden geliefert.

16 Pilzgenera / 50 Pilzspezies - in 2,5 Stunden

FÜR FoRSCHUNGSZWECKE - BREITER MOLEKULARER PILZTEST

Cube Dx bietet eine schnelle und umfangreiche DNA-basierte Identifizierung von Pilzen aus unterschiedlichen Proben für Forschungszwecke. Durch die Verwendung unsere GINA-Probenaufbereitung kann auch die Gesamtzeit zum Resultat für "schwierige" Proben wie Haut- oder Nagelschuppen drastisch verkürzt werden. 

Als Probe kann beispielsweise 0,5mL frisches EDTA-Blut dienen, die mit der GINA Probenaufbereitung vorbereitet wird. Es können aber auch jegliche andere Proben - von BAL über Urin, CSF, Gewebe bis hin zu Haut, Nägel oder Haare - verwendet werden. Als Eingangsmaterial des Tests dient demnach die im Eluat enthaltende Proben-DNA.

Die angereicherte mikrobielle DNA wird mit den PCR-Mastermix amplifiziert und positive Proben werden in die hybcell-Kartuschen überführt und die Pilze durch das compact sequencing identifiziert. Die Ergebnisse werden automatisch in einem kompakten Bericht zusammengefasst.

Molekulare Mikrobiologie – Literatur

VERFÜGBARE LITERATUR